MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020292	ATA	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822615
2	NC_020292	ATTA	2	8	202	209	50 %	50 %	0 %	0 %	451822615
3	NC_020292	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822615
4	NC_020292	TTAT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	451822615
5	NC_020292	ATT	2	6	511	516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822615
6	NC_020292	ATA	2	6	612	617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822615
7	NC_020292	GTT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822615
8	NC_020292	GAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822615
9	NC_020292	AAGA	2	8	856	863	75 %	0 %	25 %	0 %	451822615
10	NC_020292	AAT	2	6	925	930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822616
11	NC_020292	A	7	7	972	978	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
12	NC_020292	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
13	NC_020292	GTTACA	2	12	1003	1014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822616
14	NC_020292	A	8	8	1033	1040	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
15	NC_020292	AGA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822616
16	NC_020292	A	6	6	1109	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
17	NC_020292	AGA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822616
18	NC_020292	TTA	2	6	1132	1137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822616
19	NC_020292	A	6	6	1144	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
20	NC_020292	AT	4	8	1163	1170	50 %	50 %	0 %	0 %	451822616
21	NC_020292	AATT	2	8	1190	1197	50 %	50 %	0 %	0 %	451822616
22	NC_020292	A	6	6	1207	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	451822616
23	NC_020292	ATTT	2	8	1323	1330	25 %	75 %	0 %	0 %	451822617
24	NC_020292	ATA	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822617
25	NC_020292	TTA	2	6	1434	1439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822617
26	NC_020292	ACC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451822617
27	NC_020292	AAT	3	9	1489	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822617
28	NC_020292	CATT	2	8	1521	1528	25 %	50 %	0 %	25 %	451822617
29	NC_020292	ATA	2	6	1571	1576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822617
30	NC_020292	ACC	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451822617
31	NC_020292	CTT	2	6	1603	1608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822617
32	NC_020292	CAT	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822617
33	NC_020292	ATA	2	6	1670	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822617
34	NC_020292	ATTT	2	8	1721	1728	25 %	75 %	0 %	0 %	451822617
35	NC_020292	A	6	6	1747	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	451822617
36	NC_020292	T	6	6	1793	1798	0 %	100 %	0 %	0 %	451822617
37	NC_020292	TCA	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
38	NC_020292	AT	3	6	2109	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	451822618
39	NC_020292	T	6	6	2116	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
40	NC_020292	ATTTT	2	10	2147	2156	20 %	80 %	0 %	0 %	451822618
41	NC_020292	TTC	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
42	NC_020292	TCTA	2	8	2197	2204	25 %	50 %	0 %	25 %	451822618
43	NC_020292	TTTA	2	8	2239	2246	25 %	75 %	0 %	0 %	451822618
44	NC_020292	TTA	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822618
45	NC_020292	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
46	NC_020292	GCT	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822618
47	NC_020292	AG	3	6	2339	2344	50 %	0 %	50 %	0 %	451822618
48	NC_020292	TCA	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
49	NC_020292	TTC	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
50	NC_020292	AAGA	2	8	2461	2468	75 %	0 %	25 %	0 %	451822618
51	NC_020292	CTTC	2	8	2483	2490	0 %	50 %	0 %	50 %	451822618
52	NC_020292	CAT	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
53	NC_020292	TGT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822618
54	NC_020292	TTC	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
55	NC_020292	TAA	2	6	2648	2653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822618
56	NC_020292	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822618
57	NC_020292	TAA	2	6	2697	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822618
58	NC_020292	TAA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822618
59	NC_020292	T	6	6	2750	2755	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
60	NC_020292	TCA	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
61	NC_020292	TA	3	6	2821	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	451822618
62	NC_020292	TCTA	2	8	2827	2834	25 %	50 %	0 %	25 %	451822618
63	NC_020292	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822618
64	NC_020292	T	7	7	2876	2882	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
65	NC_020292	A	6	6	2894	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	451822618
66	NC_020292	GTA	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822618
67	NC_020292	GAA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822618
68	NC_020292	T	6	6	2960	2965	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
69	NC_020292	TAAAA	2	10	2993	3002	80 %	20 %	0 %	0 %	451822618
70	NC_020292	AT	3	6	3006	3011	50 %	50 %	0 %	0 %	451822618
71	NC_020292	CTT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
72	NC_020292	TCA	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
73	NC_020292	TTC	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
74	NC_020292	TC	3	6	3116	3121	0 %	50 %	0 %	50 %	451822618
75	NC_020292	T	8	8	3183	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
76	NC_020292	TGT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822618
77	NC_020292	TTA	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822618
78	NC_020292	TCA	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
79	NC_020292	TAA	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822618
80	NC_020292	ATC	2	6	3358	3363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822618
81	NC_020292	T	6	6	3395	3400	0 %	100 %	0 %	0 %	451822618
82	NC_020292	TTC	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822618
83	NC_020292	TAT	2	6	3433	3438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822618
84	NC_020292	TCAT	2	8	3455	3462	25 %	50 %	0 %	25 %	451822618
85	NC_020292	AGT	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822619
86	NC_020292	TGC	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822619
87	NC_020292	ATG	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822619
88	NC_020292	ACAA	2	8	4453	4460	75 %	0 %	0 %	25 %	451822619
89	NC_020292	ACT	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822619
90	NC_020292	AATTT	2	10	4574	4583	40 %	60 %	0 %	0 %	451822619
91	NC_020292	ATT	2	6	4645	4650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822619
92	NC_020292	GT	3	6	4663	4668	0 %	50 %	50 %	0 %	451822619
93	NC_020292	AAT	2	6	4669	4674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822619
94	NC_020292	TTC	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822619
95	NC_020292	ATTC	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	451822619
96	NC_020292	ATT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822619
97	NC_020292	CAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822619
98	NC_020292	CAT	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822619
99	NC_020292	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822619
100	NC_020292	CTA	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822619
101	NC_020292	AAG	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822619
102	NC_020292	CAT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822619
103	NC_020292	CAAC	2	8	5122	5129	50 %	0 %	0 %	50 %	451822619
104	NC_020292	TA	3	6	5140	5145	50 %	50 %	0 %	0 %	451822619
105	NC_020292	TACCAA	2	12	5169	5180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451822619
106	NC_020292	TGG	2	6	5187	5192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822619
107	NC_020292	CAG	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822619
108	NC_020292	TAA	2	6	5300	5305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822619
109	NC_020292	AAC	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822619
110	NC_020292	TTCAAG	2	12	5412	5423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451822619
111	NC_020292	TAA	2	6	6340	6345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822620
112	NC_020292	AAC	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822620
113	NC_020292	ATG	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822620
114	NC_020292	TAG	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822620
115	NC_020292	TGC	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822620
116	NC_020292	TAAA	2	8	6531	6538	75 %	25 %	0 %	0 %	451822620
117	NC_020292	AT	3	6	6553	6558	50 %	50 %	0 %	0 %	451822620
118	NC_020292	CTA	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822620
119	NC_020292	TA	3	6	7650	7655	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
120	NC_020292	TA	3	6	7665	7670	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
121	NC_020292	TTA	2	6	7744	7749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822621
122	NC_020292	TTAA	2	8	7809	7816	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
123	NC_020292	ATG	2	6	7834	7839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822621
124	NC_020292	CTG	2	6	7850	7855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822621
125	NC_020292	GAA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822621
126	NC_020292	AT	4	8	8007	8014	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
127	NC_020292	TTC	2	6	8084	8089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822621
128	NC_020292	CAAAAT	2	12	8110	8121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451822621
129	NC_020292	ATA	2	6	8179	8184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822621
130	NC_020292	ATT	2	6	8206	8211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822621
131	NC_020292	AGAA	2	8	8216	8223	75 %	0 %	25 %	0 %	451822621
132	NC_020292	AGAA	2	8	8429	8436	75 %	0 %	25 %	0 %	451822621
133	NC_020292	GTA	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822621
134	NC_020292	AATA	2	8	8454	8461	75 %	25 %	0 %	0 %	451822621
135	NC_020292	CTGC	2	8	8505	8512	0 %	25 %	25 %	50 %	451822621
136	NC_020292	CATA	2	8	8561	8568	50 %	25 %	0 %	25 %	451822621
137	NC_020292	AAG	2	6	8571	8576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822621
138	NC_020292	TAA	2	6	8612	8617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822621
139	NC_020292	GAT	2	6	8625	8630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822621
140	NC_020292	TA	3	6	8637	8642	50 %	50 %	0 %	0 %	451822621
141	NC_020292	TAA	2	6	8660	8665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822621
142	NC_020292	ACT	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822621
143	NC_020292	AATG	2	8	9328	9335	50 %	25 %	25 %	0 %	451822622
144	NC_020292	CAAA	2	8	9353	9360	75 %	0 %	0 %	25 %	451822622
145	NC_020292	AAAAGA	2	12	9454	9465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451822622
146	NC_020292	GTA	2	6	9506	9511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822622
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150	NC_020292	AAGC	2	8	9917	9924	50 %	0 %	25 %	25 %	451822622
151	NC_020292	AATAGT	2	12	9926	9937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451822622
152	NC_020292	ATTT	2	8	9966	9973	25 %	75 %	0 %	0 %	451822622
153	NC_020292	TGA	2	6	9994	9999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822622
154	NC_020292	TCA	2	6	10046	10051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822622
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156	NC_020292	AAAT	2	8	10221	10228	75 %	25 %	0 %	0 %	451822622
157	NC_020292	AAT	2	6	10259	10264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822622
158	NC_020292	TAT	2	6	10294	10299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822622
159	NC_020292	TAT	2	6	10345	10350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822622
160	NC_020292	ATTAT	2	10	10360	10369	40 %	60 %	0 %	0 %	451822622
161	NC_020292	CTT	2	6	10392	10397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822622
162	NC_020292	TGA	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822622
163	NC_020292	TGA	2	6	10462	10467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822622
164	NC_020292	TAA	2	6	10546	10551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822622
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166	NC_020292	ATA	2	6	10626	10631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822622
167	NC_020292	ATA	2	6	10650	10655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822622
168	NC_020292	TTA	2	6	10706	10711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822622
169	NC_020292	AT	4	8	10718	10725	50 %	50 %	0 %	0 %	451822622
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171	NC_020292	GAAGA	2	10	10836	10845	60 %	0 %	40 %	0 %	451822622
172	NC_020292	CAA	3	9	10857	10865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822622
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175	NC_020292	TGT	2	6	11008	11013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822622
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179	NC_020292	TAA	2	6	11136	11141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822622
180	NC_020292	ATA	2	6	11148	11153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822622
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243	NC_020292	AT	4	8	14568	14575	50 %	50 %	0 %	0 %	451822627
244	NC_020292	TGA	2	6	14620	14625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822627
245	NC_020292	GTA	2	6	14646	14651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822627
246	NC_020292	T	7	7	14676	14682	0 %	100 %	0 %	0 %	451822627
247	NC_020292	AATA	2	8	14777	14784	75 %	25 %	0 %	0 %	451822627
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249	NC_020292	AGA	2	6	14812	14817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822627
250	NC_020292	AAAT	2	8	14820	14827	75 %	25 %	0 %	0 %	451822627
251	NC_020292	ATAA	2	8	14915	14922	75 %	25 %	0 %	0 %	451822627
252	NC_020292	TAT	2	6	15065	15070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822627
253	NC_020292	CTT	2	6	15081	15086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822627
254	NC_020292	TAC	2	6	15118	15123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822627
255	NC_020292	AGC	2	6	15151	15156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822627
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257	NC_020292	TAA	2	6	15208	15213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822627
258	NC_020292	GAT	2	6	15263	15268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822627
259	NC_020292	TCTTA	2	10	15312	15321	20 %	60 %	0 %	20 %	451822627
260	NC_020292	AT	3	6	15341	15346	50 %	50 %	0 %	0 %	451822627
261	NC_020292	A	6	6	15408	15413	100 %	0 %	0 %	0 %	451822627
262	NC_020292	TGTATC	2	12	15466	15477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451822627
263	NC_020292	T	7	7	15505	15511	0 %	100 %	0 %	0 %	451822627
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265	NC_020292	TAA	2	6	15633	15638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822628
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400	NC_020292	ATGA	2	8	21972	21979	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
401	NC_020292	GGAT	2	8	22001	22008	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
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